爲健全本校內控機制並配合政府政策，本校業於100年成立「內部控制專案小組」，並於101年訂定「內部控制制度」，俾利落實內控之執行。「內部控制制度」包含學校整體層級目標與作業層級目標、風險評估、作業說明等，並根據控制重點訂定有自行評估表，以供各業務單位定期自行評估內控執行情形。另為監督校內各單位之內部控制是否有效運作，業於102年制訂「內部控制制度稽核小組作業要點」，俾使本校各單位透過內部稽核作業程序，適時發現問題，立即採取應變及改善措施，以確認並維持各項作業之合法性、正確性，協助校長合理確保內部控制制度之有效程度，以利達成施政目標。內部稽核小組並於103年2月起，分別至各單位執行內部稽核年度稽核計畫。